Structural basis for co-transcriptional nucleosome reassembly mediated by Spt6

Project name in Czech
Strukturní podstata pro opětovné sestavení nukleosomu při přepisu genu zprostředkovaná proteinem Spt6
Annotation in Czech
Elongační faktor Spt6 interaguje s RNA polymerázou II (Pol II) a působí jako histonový chaperon, který podporuje opětovné sestavení nukleosomů po průchodu polymerázy. Přesný mechanismus opětovného sestavení nukleosomů zprostředkovaný faktorem Spt6 zůstává nejasný. Navrhujeme studovat opětovné sestavení nukleosomů zprostředkované Spt6 kombinací kryoelektronové mikroskopie (kryo-EM) a biochemických přístupů. Budeme zkoumat strukturní podstatu autoinhibice a aktivace faktoru Spt6, který je zprostředkován jeho N-terminální oblastí a dále jak Spt6 interaguje s histony a nukleosomem. Dále budeme studovat v definovaném biochemickém systému, jak Spt6 spolupracuje s dalšími elongačními faktory Spt4/5 a Pol II, což vede účinnému sestavení nukleosomů, a také určíme strukturu transkripčního komplexu Pol II–Spt4/5–nukleosom navázaným na Spt6 pomocí kryo-EM. Naše studie odhalí roli důležitosti spolupráce mezi vnitřně neuspořádanými a strukturovanými oblastmi Spt6, které regulují vazbu na nukleosom a Pol II, a opětovné sestavení nukleosomů.

R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology

Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Mar 12, 2025

Similar projects(10)