Expanding the analytical toolbox for structural mass spectrometry
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202200004
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
22-27695S
Alternative language
Project name in Czech
Rozšíření analytických nástrojů pro strukturní hmotnostní spektrometrii
Annotation in Czech
Biologická hmotnostní spektrometrie se stala nepostradatelnou technikou integrativní strukturní biologie. Pokrývá velmi širokou škálu analytických metod, z nichž chemické sítění představuje nejrozšířenější techniku. Navzdory své popularitě a narůstajícímu počtu uživatelů, má tato technika své limitace dané především omezeným množstvím spolehlivě fungujících chemických sond, které jsou navíc zaměřené jen na část reaktivních skupin v proteinech. V rámci tohoto návrhu plánujeme rozšířit paletu síťovacích činidel a také vylepšit vlastnosti stávajících sond. To bude zahrnovat izotopové značení a selektivně štěpitelné sondy, což usnadní identifikaci produktů sítění ve složitých směsích. Dále zavedeme analytické postupy vhodné pro kvantifikaci síťovaných produktů, popíšeme optimální postupy fragmentace poskytující nejvyšší výtěžek sekvenčních informací a vytvoříme program pro interpretaci získaných dat. Vše nakonec budeme aplikovat na biologicky relevantní proteinové systémy.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10406 - Analytical chemistry
OECD FORD - secondary branch
10609 - Biochemical research methods
OECD FORD - another secondary branch
30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CB - Analytical chemistry, separation<br>CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology<br>EI - Biotechnology and bionics
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
—
Latest support payment
Feb 29, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Mar 12, 2025
Finance
Total approved costs
6,336 thou. CZK
Public financial support
6,336 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK