Deciphering the relationship between homologous recombination and gene silencing
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202300001
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
23-05284S
Alternative language
Project name in Czech
Rozluštění vztahu mezi homologní rekombinací a umlčením genů
Annotation in Czech
Současná aktivita transkripce a replikace nebo opravy DNA ve stejné genomové oblasti může být významným zdrojem nestability genomu a vyžaduje vhodnou regulaci. Nedávno byla pozorována zajímavá souvislost mezi homologní rekombinací (HR) a umlčením genů, ale odpovědné procesy zůstávají neznámé. V tomto projektu se pokusíme tyto procesy objasnit a identifikovat zúčastněné hráče a mechanismy s využitím poltivé kvasinky jako modelového organismu. Použijeme víceúrovňový přístup, který integruje transkripční, chromatinové a molekulární analýzy, abychom ukázali, že umlčování genů je inherentním mechanismem replikační dráhy závislé na rekombinaci. Ukážeme, že umlčení závisí na bariérách replikační vidlice a vyskytuje se převážně během replikace DNA. Také identifikujeme zodpovědné změny chromatinu a molekulární mechanismy, včetně klíčové role komplexu SMC5/6. Vzhledem k nejasné úloze SMC5/6 a dalších podílejících se faktorů v omezení transkripce virové DNA je hlubší pochopení jejich propojení s umlčováním genů velmi důležité.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Mar 27, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
7,260 thou. CZK
Public financial support
7,260 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK