Single-cell transcriptomics for the analysis of subclonal heterogeneity and clonal evolution of mantle cell lymphoma
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202300001
Main participants
Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
23-05377S
Alternative language
Project name in Czech
Transkriptomika na úrovni jednotlivých buněk jako nástroj pro studium subklonální heterogenity a klonálního vývoje u lymfomu z plášťových buněk
Annotation in Czech
Mantle cell lymfom (MCL) je chronicky relabující typ lymfomu. Molekulární mechanismy asociované s relapsem MCL jsou do značné míry neznámé. Lymfomové linie a pacientské xenografty (patient-derived xenografts, PDXs) představují klíčové nástroje pro širokou paletu preklinického výzkumu. Za použití single-cell RNA sekvenování (scRNA seq) porovnáme vzorky získané od pacientů s MCL při diagnóze a při relapsu choroby. Pomocí stejné technologie (scRNA-seq) porovnáme transkriptomy nových lymfomových linií a PDX tumorů odvozených od jednoho pacienta. Odhalíme nové molekulární mechanismy asociované s relapsem MCL. Porovnáním subklonální heterogenity lymfomových linií a PDX modelů odvozených od jednoho pacienta přineseme důkaz o relevanci těchto modelů pro preklinický výzkum.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
30205 - Hematology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
FD - Oncology and haematology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Apr 24, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
15,740 thou. CZK
Public financial support
15,716 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
24 thou. CZK