Evolutionary new centromeres in plants
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202300001
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
23-06840S
Alternative language
Project name in Czech
Nové evoluční centroméry rostlin
Annotation in Czech
Centroméry jsou nezbytné pro správnou segregaci monocentrických chromosomů. Vznik nových centromér na stejném chromosomu je označován jako repozice centromér (RC), respektive jako nové evoluční centroméry (NEC). Domníváme se, že vznik a zrání nových centromér může modifikovat epigenetickou krajinu, transkripci, rekombinaci na daném chromosomu, a může vést k reprodukční izolaci a speciaci. Tribus Arabideae z čeledi brukvovitých je skupinou s nejvyšším počtem dokumentovaných NEC u rostlin. Pokročilé sekvenování dlouhých čtení, společně s novými algoritmy sestavování genomových sekvencí umožňují telomere-to-telomere sekvenování, včetně čtení komplexních (peri)centromerických oblastí. Navrhujeme analyzovat NEC u Arabideae druhů s použitím sekvenování dlouhých čtení, doplněné o cytogenomické a epigenetické analýzy, s cílem zkoumat strukturu ENC a dopady RC na rekombinaci, transkripci, a reporodukční izolaci. Výsledky projektu poskytnou nové poznatky o životním cyklu komplexních centromér rostlin.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Apr 24, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
12,446 thou. CZK
Public financial support
12,446 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK