Modulating ABA signaling pathways by alternative splicing of ABI2
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202300001
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
23-08067S
Alternative language
Project name in Czech
Modulace signálních drah ABA pomocí alternativního sestřihu ABI2
Annotation in Czech
Detailní transkriptomické studie ukázaly, že většina rostlinných genů je extenzivně regulována alternativním sestřihem (AS). Existují argumenty, že AS často vede k produkci zkrácené dominantně negativních proteinových isoforem, které interferují s následnými procesy. ABI2, centrální aktér v signální dráze rostlinného hormonu abscisové kyseliny (ABA) podléhá fyziologicky relevantnímu, evolučně konzervovanému AS, jenž vede k retenci jeho posledního intronu. Naše předběžná data naznačují, že AS mění schopnost ABI2 selektivně vázat známé interaktory, a to nejen ty zapojené v klasické signální dráze ABA. Spojením expertíz v genetice, interaktomice a strukturní biofyzice, máme za cíl popsat způsob interakce mezi kanonickou a alternativní dominantně negativní isoformou ABI2 s ostatními proteiny spřízněnými se signální dráhou ABA. Rovněž budeme studovat fyziologicktéto sestřihové události, s ohledem na identifikované změny v protein-proteinových interakcích.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
20801 - Environmental biotechnology
OECD FORD - secondary branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EF - Botany<br>EI - Biotechnology and bionics
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Feb 29, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 21, 2025
Finance
Total approved costs
8,312 thou. CZK
Public financial support
8,312 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK