A pangenomic view of expanding centromere
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202400001
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
24-10036S
Alternative language
Project name in Czech
Pangenomický pohled na expandující centromeru
Annotation in Czech
Centromery jsou oblasti chromozómů, které zajišťují správnou segregaci genetického materiálu během buněčného dělení. Navzdory své konzervované funkci vykazují centromery velkou variabilitu ve velikosti, struktuře a sekvenčním složení. Význam této variability a evoluční procesy, které k ní vedou, jsou však většinou neznámé, což brání našemu pochopení obecných principů biologie centromer. Abychom tuto mezeru ve znalostech odstranili, navrhujeme objasnit mechanismy evoluce centromer srovnávací analýzou jejich kompletních nukleotidových sekvencí, které se staly dostupnými díky nedávnému pokroku v technologiích sekvenování a skládání genomů. Náš přístup bude pangenomický, což znamená, že budeme zkoumat sekvenční a epigenetickou variabilitu mezi centromerami mnoha genotypů v rámci jednoho druhu a jeho blízce příbuzných taxonů. Navrhovaný výzkum se zaměří na hrách (Pisum spp.) a jemu příbuzné rody, které vykazují rychlou evoluční dynamiku svých centromer, což dokládá expanze velikosti těchto oblastí za vzniku metapolycentrických chromozomů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2024
Realization period - end
Dec 31, 2026
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 22, 2024
Finance
Total approved costs
10,483 thou. CZK
Public financial support
10,483 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK