Discovering new pathways for the regulation of gene expression by small RNAs in plants
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202400001
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
24-12869S
Alternative language
Project name in Czech
Objevování nových drah regulace genové exprese malými RNA v rostlinách
Annotation in Czech
Malé RNA (sRNA) jsou důležitými regulátory genové exprese ve vývoji, protivirové obraně a adaptaci rostlin na měnící se podmínky prostředí. Je o nich známo, že buďto blokují transkripci indukcí metylace DNA, nebo potlačují expresi genů posttranskripčně. Náš projekt testuje hypotézu, že sRNA působí také v komplexu RNA Polymerase II, kde mohou kotranskripčně modulovat úpravy pre-mRNA nebo ovlivňovat značení chromatinu. Kandidátem na zprostředkování těchto nekanonických účinků sRNA je SPT6L, nepostradatelný transkripční faktor Pol II s histon-chaperonovou aktivitou. SPT6L by také mohl být chybějícím článkem v de novo metylaci naivních lokusů tím, že rekrutuje rostlinně specifickou RNA Pol V. Při výzkumu SPT6L se nám podařilo zrušit jeho interakci s sRNA a tato cílená mutace vedla k časnému kvetení u Arabidopsis. Analýzy souvisejících změn transkriptomu a chromatinu a nalezení proteinových interaktorů SPT6L by měly odhalit mechanismy nových regulačních drah zprostředovaných malými RNA. Naše výsledky rozšíří znalosti o regulaci genové exprese a mohou mít i biotechnologický význam.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10601 - Cell biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EA - Morphology and cytology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2024
Realization period - end
Dec 31, 2026
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
Mar 18, 2024
Finance
Total approved costs
7,148 thou. CZK
Public financial support
7,148 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK