All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Discovering new pathways for the regulation of gene expression by small RNAs in plants

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    SGA0202400001

  • Main participants

    Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    24-12869S

Alternative language

  • Project name in Czech

    Objevování nových drah regulace genové exprese malými RNA v rostlinách

  • Annotation in Czech

    Malé RNA (sRNA) jsou důležitými regulátory genové exprese ve vývoji, protivirové obraně a adaptaci rostlin na měnící se podmínky prostředí. Je o nich známo, že buďto blokují transkripci indukcí metylace DNA, nebo potlačují expresi genů posttranskripčně. Náš projekt testuje hypotézu, že sRNA působí také v komplexu RNA Polymerase II, kde mohou kotranskripčně modulovat úpravy pre-mRNA nebo ovlivňovat značení chromatinu. Kandidátem na zprostředkování těchto nekanonických účinků sRNA je SPT6L, nepostradatelný transkripční faktor Pol II s histon-chaperonovou aktivitou. SPT6L by také mohl být chybějícím článkem v de novo metylaci naivních lokusů tím, že rekrutuje rostlinně specifickou RNA Pol V. Při výzkumu SPT6L se nám podařilo zrušit jeho interakci s sRNA a tato cílená mutace vedla k časnému kvetení u Arabidopsis. Analýzy souvisejících změn transkriptomu a chromatinu a nalezení proteinových interaktorů SPT6L by měly odhalit mechanismy nových regulačních drah zprostředovaných malými RNA. Naše výsledky rozšíří znalosti o regulaci genové exprese a mohou mít i biotechnologický význam.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • OECD FORD - main branch

    10601 - Cell biology

  • OECD FORD - secondary branch

  • OECD FORD - another secondary branch

  • CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    EA - Morphology and cytology

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2024

  • Realization period - end

    Dec 31, 2026

  • Project status

    Z - Beginning multi-year project

  • Latest support payment

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP24-GA0-GA-R

  • Data delivery date

    Mar 18, 2024

Finance

  • Total approved costs

    7,148 thou. CZK

  • Public financial support

    7,148 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK