Protein liquid-liquid phase separation and intrinsic disorder in bacterial transcription
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202500001
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
25-16037S
Alternative language
Project name in Czech
Fázová separace kapalina-kapalina a přirozená neuspořádanost proteinů v bakteriální transkripci
Annotation in Czech
Výsledkem separace bílkovin v kapalné fázi (LLPS) jsou kondenzáty, které hrají v buňce klíčovou roli. LLPS často závisí na vnitřně neuspořádaných proteinech. O LLPS u bakterií je známo velmi málo. Nedávno jsme pozorovali neočekávanou LLPS u částečně neuspořádaného mykobakteriálního faktoru sigma (SigA, podjednotka RNAP) in vitro. To naznačuje, že bakterie může využívat LLPS k organizaci svého transkripčního aparátu. Dále jsme identifikovali dosud neznámý transkripční faktor (UCP7) ze stejné bakterie složený ze strukturovaných a neuspořádaných částí. Navrhujeme prozkoumat význam LLPS v bakteriální transkripci s využitím Mycobacterium smegmatis jako modelového systému. Popíšeme dynamiku proteinů SigA a UCP7 a charakterizujeme jejich schopnost tvořit LLPS. Definujeme role jejich nestrukturovaných částí v transkripci. Celkově pak projekt poskytne komplexní model fungování nestrukturovaných částí bakteriálního transkripčního aparátu a odhalí, zda/jak LLPS ovlivňuje expresi prokaryotických genů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2025
Realization period - end
Dec 31, 2027
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Mar 10, 2025
Finance
Total approved costs
17,467 thou. CZK
Public financial support
17,467 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK