Structural protein disorder brings order into bacterial transcription
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202200004
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
22-12023S
Alternative language
Project name in Czech
Neuspořádanost proteinových struktur vnáší řád do bakteriální transkripce
Annotation in Czech
Naše znalost přirozeně neuspořádaných proteinů je dosud v počátcích. Podjednotka delta bakteriální RNA polymerasy (RNAP), obsahující přirozeně neuspořádanou C-terminální doménu (CTD), je typickým příkladem takového proteinu. Delta je důležitá pro regulaci transkripce a přežití buněk v kompetitivním prostředí. Navzdory rozsáhlým studiím tohoto proteinu jsou interakce CTD s RNAP a jejich role v transkripci v podstatě neznámé. Navrhujeme (1) určit dosud neznámé struktury iniciačních komplexů RNA s deltou a primárním sigma faktorem (SigA) pomocí kryoelektronové mikroskopie (EM), (2) strukturně charakterizovat deltu S. aureus, jejíž sekvence je unikátní vzhledem k ostatním druhům a (3) popsat dynamiku, intermolekulární interakce a následně roli CTD delty v iniciačních komplexech obsahujících RNAP-SigA pomocí nukleární magnetické rezonance a(nebo) kryo-EM. Tato studie tak přinese naléhavě potřebnou informaci o funkci přirozeně neuspořádaných proteinů v klíčovém procesu transkripce.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Mar 10, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
11,997 thou. CZK
Public financial support
11,997 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK