RNA polymerase: The ?meeting point? of regulatory networks
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P302-11-0855
Alternative language
Project name in Czech
RNA polymeráza: Průsečík regulačních sítí
Annotation in Czech
Porozumění molekulárnímu aparátu bakteriální buňky je klíčové pro vývoj nových antibakteriálních látek. RNA polymeráza (RNAP) je esenciální pro genovou expresi. V současnosti jsme vyřešili strukturu podjednotky delta RNAP a objasnili její fyziologickou roli. V průběhu těchto studií jsme identifikovali proteiny, které interagují s touto podjednotkou nebo s bakteriální RNAP. V tomto projektu navrhujeme studovat strukturně-funkční vztahy těchto proteinů: (i) omega1, dosud nestudovaná podjednotka RNAP; (ii)TRAP, extenzivně studovaný protein jehož přítomnost na RNAP nebyla dosud popsána a jenž jsme identifikovali na RNAP; (iii) SP_2234, protein o neznámé funkci, který jsme identifikovali jako interakčního partnera podjednotky delta; (iv) YvgS, helikázu, kterou jsme identifikovali jako vázající se na RNAP. Navrhovaný výzkum bude zaměřen na určení fyziologické role interakcí těchto proteinů s RNAP za použití biochemických, genetických a strukturních přístupů. Tento projekt prohloubí naše znalosti o RNAP jako molekule, kde konvergují různé signály, jsou interpretovány, a ovlivňují transkripční výstup. Nové znalosti získané v tomto projektu mohou pak pomoci při vývoji nových antibakteriálních látek zacílených na RNAP.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Project was focused on functional evaluation of newly identified factors interacting with RNA polymerase. The data in final report are valid and adequate. This project significantly increased our knowledge about bacterial TFs and transcription in general. There were 8 papers in prestigious journals with IF. Řešení projektu a čerpání prostředků bylo v souladu s pravidly.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 28, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
May 22, 2015
Finance
Total approved costs
8,905 thou. CZK
Public financial support
8,905 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK