How does the genome feel the heat? Effect of incubation temperatures on gene expression, transposon activity and recombination in squamate reptiles.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202500001
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
25-16674S
Alternative language
Project name in Czech
Jak genom cítí teplotu? Vliv inkubační teploty na genovou expresi, aktivitu transpozonů a rekombinaci u šupinatých plazů.
Annotation in Czech
Vejcorodí plazi jsou během inkubace vajec obzvláště citliví na okolní teplotu následkem jejich silné fyziologické reakce na teplotní podmínky a absence rodičovské péče u většiny druhů. Předchozí studie doložily, že teplota ovlivňuje regulaci genové exprese a může vést k vývojové plasticitě. Kromě toho může teplota při inkubaci vajec ovlivnit i pozdější životní stádia, jakož i znaky life-history, fyziologii a fenotyp. V rámci tohoto projektu se zaměříme na inkubaci vajec pěti druhů hadů a ještěrů ve čtyřech různých konstantních teplotách. S využitím moderních cytogenetických, genomických a transkriptomických metod budeme zkoumat vliv teploty na mláďata s důrazem na tři hlavní aspekty genomové regulace a evoluce: mechanismy kompenzace genové dávky, aktivitu transpozibilních elementů a míru rekombinace.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
OECD FORD - secondary branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - another secondary branch
10613 - Zoology
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EA - Morphology and cytology<br>EB - Genetics and molecular biology<br>EG - Zoology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2025
Realization period - end
Dec 31, 2027
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 25, 2025
Finance
Total approved costs
10,971 thou. CZK
Public financial support
10,971 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK