Building Barbara McClintock’s legacy: Evolution of ribosomal DNA in chromosomal context
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202500001
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
25-16796S
Alternative language
Project name in Czech
Oživený odkaz Barbary McClintockové: Evoluce ribozomální DNA v chromozomálním kontextu
Annotation in Czech
Geny pro ribozomální RNA (rDNA) jsou předmětem intenzivního výzkumu a svou složitostí představující neustálou výzvu v molekulární biologii. rDNA sehrávají klíčovou roli v důležitých buněčných procesech jako je proteosyntéza, architektura ribozomu a epigenetická stabilizace genomu. Mechanismy mobility DNA definované již téměř před sto lety Barbarou McClintockovou měly zásadní dopad na pochopení genetické variability a evoluce genomu. Nové poznatky a metodické přístupy nás motivovaly k opětovnému otevření starých otázek souvisejících s dynamikou rDNA, jako je vztah mezi pozicí rDNA na chromozomech, jejich mobilitou, multiplicitou, homogenizací (koncertovanou evolucí), epigenetickou modifikací a expresí. K jejich zodpovězení navrhujeme testovat hypotézy s využitím nejmodernějších technik analýzy genomu, jakými jsou sestavování chromozomů od-konce do-konce (T2T), 3-D chromosome painting a editace genomu technologií CRISPR/Cas. Získané výsledky nám pomohou lépe porozumět funkci a evoluci rDNA v chromozomálním kontextu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2025
Realization period - end
Dec 31, 2027
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Apr 7, 2025
Finance
Total approved costs
15,123 thou. CZK
Public financial support
14,802 thou. CZK
Other public sources
321 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK