Protonation and coordination states critical for metallonuclease catalysis
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202500001
Main participants
Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
25-17546S
Alternative language
Project name in Czech
Protonační a koordinační stavy kritické pro katalýzu nukleasy závislé na kovech
Annotation in Czech
Protonace a přesná koordinace klíčových chemických skupin v interakcích typu protein-nukleová kyselina hraje zásadní roli při vazbách i při realizaci katalytické aktivity. Rozmístění vodíku na klíčových místech v komplexech biologických makromolekul a nukleových kyselin nebylo doposud strukturně v atomárním detailu studováno. Chybějí tedy principiální informace o protonaci vazebných míst proteinů a na chemických skupinách nukleových kyselin v závislosti na uspořádání vazeb. Aplikace neutronové difrakce a rentgenové difrakce subatomárního rozlišení umožňuje získat informace o protonaci rozhodujících míst. Pomocí kombinace těchto technik s QM/MM výpočty provedeme originální strukturní studii zaměřenou na ultravysoké rozlišení a informace o lokalizaci vodíku/protonů s využitím modelových nukleas závislých na kovech s významem pro biotechnologie a medicínu. Výsledky projektu budou zásadní pro pochopení detailů interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami a poskytnou nové, experimentálně podložené parametry pro studium struktury a funkce široké třídy proteinů zapojených v patogenezi.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10610 - Biophysics
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
BO - Biophysics
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2025
Realization period - end
Dec 31, 2027
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 27, 2025
Finance
Total approved costs
5,712 thou. CZK
Public financial support
5,712 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK