Assembly of small ribonucleoprotein particles in the cell nucleus
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
301/05/0601
Alternative language
Project name in Czech
Formování malých jaderných ribonukleoproteinových částic v buněčném jádře
Annotation in Czech
Malé jaderné ribonukleoproteinové částice (snRNP) jsou v buněčném jádře lokalizovány v nukleoplasmě a koncentrovány v jaderných strukturách nazývaných Cajalova tělíska (CB). Předpokládá se, že CB hrají roli v metabolismu snRNP, nicméně jejich role je v současnosti objektem intenzívního výzkumu. V tomto projektu navrhujeme testovat hypotézu, že CB jsou místem, kde dochází k formování U4/U6 snRNP a regeneraci U4/U6 po splicingu. Tuto hypotézu budeme testovat: 1) Detekcí komplexů vznikajících při formováníU4/U6 snRNP v buněčném jádře a zvláště pak v CB; 2) Sledováním dynamiky snRNP v živých buňkách a pozorováním, zda snRNP opakovaně cyklují skrze CB; 3) Analýzou molekulárních interakcí mezi komponenty CB a proteinem SART3/p110, který je důležitým faktorem při formování U4/U6 snRNP. Formující se U4/U6 snRNP budou detekovány pomocí přenosu fluorescenční resonanční energie (FRET). Pro sledování pohybu snRNP v jádře bude použit nedávno vyvinutý fotoaktivovatelný GFP. Imunoprecipitace a in
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EA - Morphology and cytology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Small nuclear ribonucleoprotein particles (snRNPs) are basic building blocks of the spliceosome that catalyzes pre-mRNA splicing. The aim of this project was to analyze formation of snRNPs and the spliceosome in the cell nucleus and determine a role of n
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 2, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-GA0-GA-U/04:3
Data delivery date
Dec 16, 2008
Finance
Total approved costs
3,973 thou. CZK
Public financial support
3,932 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
61 thou. CZK