Deconvolution image restoration in the studies of the cell nucleus architecture
Project goals
The aim of the proposed project is to combine two main approaches of high-resolution microscopy in the research of the architecture of the cell nucleus. We do foresee that the substantial increase in the space resolution of the light microscope using botthe confocal imaging and image restoration methods (deconvolution analysis) will present a major help in the fulfilment of the aims of the project GAER 304/00/1481. We will focus on the organization of the interphase chromatin - with the aim to determinethe uniformity of the replica foci during the whole S-phase of the cell cycle, determine the length of the replicons using the localization of the newborn DNA on a single chromosome (chromatine fibre); on the localization of maturing RNA in the nuclear compartments - we will monitore the maturation steps of the ribosomal RNA within the nucleolus.
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Dekonvoluční analýza obrazu při studiu architektury buněčného jádra
Annotation in Czech
Cílem navrhovaného projektu je využít kombinace dvou metod optické mikroskopie vysokého rozlišení při studiu architektury buněčného jádra. Předpokládáme, že podstatným zvýšením rozlišovací schopnosti optického mikroskopu použitím jednak konfokálního zobrazení, jednak numerické metody zpětné rekonstrukce obrazu (dekonvoluční analýzy), přispěje k vyřešení důležitých částí projektu GA ČR 304/00/1481. Soustředíme se na studium organizace interfázního chromatinu s cílem prokázat jednotný charakter replikačních center během celé S-fáze buněčného cyklu za využití lokalizace nově vznikající DNA na jednotlivém chromosomu pro stanovení délky replikonů; dále pak na studium lokalizace vyzrávající RNA v rámci jaderných kompartmentů - budeme monitorovat maturační kroky ribosomální RNA v jadérku.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
EA - Morphology and cytology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
10601 - Cell biology
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Využitím technologie dekonvoluční analýzy obrazu bylo dosaženo významných výsledků při studiu funkčních projevů nukleolárního chromatinu. Údaje získané řešitelem jsou unikátní a navazují na tradici pracoviště. Výsledkem jsou 3 publikace v prestižních čas
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2000
Realization period - end
Jan 1, 2002
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2003/GA0/GA03GA/U/N/9:7
Data delivery date
May 19, 2008
Finance
Total approved costs
638 thou. CZK
Public financial support
459 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
231 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
638 CZK thou.
Public support
459 CZK thou.
71%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
EA - Morphology and cytology
Solution period
01. 01. 2000 - 01. 01. 2002