Mapping of acceptor sites for unlinked transposed Ds elements in tomato

Provider

Czech Science Foundation

Programme

Standard projects

Call for proposals

—

Main participants

Ústav molekulární biologie rostlin AV ČR

Contest type

—

Contract ID

—

Project name in Czech

Mapování akceptorových míst pro nevazebně transponovaný mobilní element Ds u rajčete

Annotation in Czech

U rajčete bude studována transpozice geneticky značených mobilních elementů Ds. Cílem bude zjistit, zda u rajčete existuje, podobně jako u kukuřice, nenáhodná chromozonová distribuce akceptorových míst pro nevazebně transponované mobilní elementy Ds, odrážející pravděpodobně uspořádání chromozomů v interfázním jádře. Proto bude u obou studovaných donorových lokusů určena mapová pozice zhruba 30 trDs elementů. Ke splnění tohoto cíle budou linie, nesoucí nevazebně transponovaný element Ds odlišeny od linií s trDs ve vazbě s donorovou T-DNA pomocí PCR. Sekvence DNA rajčete přiléhající k nevazebně trasponovaným elementům Ds budou izolovány za použití IPCR a poté použity pro RFLP mapování. Analýza distribuce akceptorových míst bude moci poskytnout zajímavýpohled na uspořádání chromozomů interfázního jádra a jednotlivé linie nesoucí Ds elementy ve známé poloze budou využitelné k cílenému genovému taggingu. Všechny transgenní linie, které budou v tomto projektu použity, byly vytvořeny v Sainsbury Laboratory

R&D category

—

CEP classification - main branch

GE - Plant cultivation

CEP - secondary branch

EB - Genetics and molecular biology

CEP - another secondary branch

—

OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Provider evaluation

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Project results evaluation

Bylo zjištěno, že u rajčete, stejně jako je tomu u kukuřice, existuje nenáhodná chromozomová distribuce akceptorových míst pro nevazebně transponované mobilní elementy Ds. Výsledky získané při řešení projektu prohlubují znalosti jednak o dynamice chování

Realization period - beginning

Jan 1, 1996

Realization period - end

Jan 1, 1998

Project status

U - Finished project

Latest support payment

—

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP/1999/GA0/GA09GA/V/6:6

Data delivery date

—

Total approved costs

2,223 thou. CZK

Public financial support

1,485 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK