The study of genome instabilities in Arabidopsis mutants deficient for DNA repair and checkpoint proteins
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 9 (SGA02006GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
522/06/0380
Alternative language
Project name in Czech
Studium genomových nestabilit u mutantů Arabidopsis defektních v reparačních proteinech
Annotation in Czech
Celistvost buněčného jádra je nezbytnou podmínkou jak pro bezchybnou funkci somatické buňky, tak pro přenos genetické informace buňkami generativními. V případě poškození DNA je v buňce spuštěna kaskáda reparačních procesů, které buď vedou k úplné opravěstruktury a funkce DNA, mohou však vést i k chybám. Ty obvykle nadále indukují další genomové nestability, jejichž závažnost i množství se mohou během dalších buněčných dělení zvyšovat. Chybně opravená DNA je tedy dalším zdrojem genomové nestability. V tomto projektu se zaměříme na mutanty Arabidopsis thaliana, které postrádají důležité faktory hrající roli v opracování poškozeného chromatinu. Vzhledem k tomu, že konce chromozomů zbavené ochranné funkce telomer jsou často rovněž zdrojem genomových nestabilit, budeme zvláštní pozornost věnovat rovněž telomerám. Ve výzkumu se zaměříme zejména na cytogenetické metody, jimiž budeme mapovat přirozené i indukované jaderné změny jak v somatických buňkách, tak i v samčím a samičím gametofytu. Výhoda
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
ED - Physiology
CEP - secondary branch
EA - Morphology and cytology
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
We studied the impact of the mutation in telomerase on the model plant Arabidopsis thaliana. Using mainly cytogenetic approaches we showed that in tert mutants the de-protected chromosome ends fuse as a consequence of the non-homologous end joining (NHEJ
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2006
Realization period - end
Dec 31, 2008
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 25, 2008
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP09-GA0-GA-U/02:2
Data delivery date
Oct 22, 2009
Finance
Total approved costs
1,795 thou. CZK
Public financial support
1,795 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK