Immune response genes in the horse
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Veterinární univerzita Brno / Fakulta veterinárního lékařství
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Studium některých genů imunitní odpovídavosti koně
Annotation in Czech
Projekt je příspěvkem k celosvětovému programu mapování genomu koně. Zaměřuje se na studium polymorfismu genů, které hrají úlohu v genetické determinaci imunitní odpovídavosti koně. U každého genu budou určeny primery vymezující jednu nebo více jeho oblastí (promotorů, exonů intronů, 3´UTR) se zaměřením na místa předpokládaného polymorfismu, bude optimalizován PCR protokol, amplifikované produkty budou subklonovány a jednotlivé klony sekvenovány. Na základě znalosti sekvencí bude učiněn pokus o vypracování typizační metody, např. RFLP nebo SSCP. Analyzovány budou tři kategorie těchto genů. U genů, jejichž sekvence není u koní známa (Nramp 1, iNOS) budou primery určeny na základě homologie s jinými, zejména příbuznými druhy. U genů, jejichž sekvence jeu koní známa, ale kde dosud nebyl popsán polymorfismus (TNF-alfa), budou určeny specifické primery. Z genů, jejichž polymorfismus byl u koní popsán, se pozornost soustředí na gen ELA-DQB, u nějž byly specifické primery pro druhý exon designov
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
GI - Farm animal breeding and farm animal pedigree breeding
CEP - secondary branch
GJ - Diseases and animal vermin, veterinary medicine
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
40203 - Husbandry<br>40301 - Veterinary science
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
1. Nově byl zjištěn polymorfismus u 8 genů imunitní odpovědi. Nově byl u koně identifikován gen NRAMP1, byla stanovena kompletní kódující nukleotidová sekvence cDNA, charakterizována genomická organizace a gen byl mapován na 6. Chromozómech metodou FISH.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1999
Realization period - end
Jan 1, 2001
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2002/GA0/GA02GA/U/N/7:3
Data delivery date
Apr 1, 2003
Finance
Total approved costs
3,132 thou. CZK
Public financial support
3,132 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK