The role of small ORFs in the pathogenesis of porcine circovirus 2 diseases
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 12 (SGA02009GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
524-09-0673
Alternative language
Project name in Czech
Role malých ORF v patogenezi cirkovirových onemocnění prasat
Annotation in Czech
Hlavním cílem projektu je určit vliv malých otevřených čtecích rámců na patogenezi různých forem cirkovirového onemocnění prasat. Genové produkty těchto čtecích rámců jsou pravděpodobně exprimovány in vivo a přispívají k rozvoji klinických příznaků onemocnění. Ačkoliv je genom cirkovirů pozoruhodně konzervovaný, zdá se, že malé genetické změny umožní diferenciaci kmenů viru dle jejich virulence. Bodové mutace mohou přispívat ke vzniku start i stop kodonů, což ovlivní i expresi malých čtecích rámců. Sekvenování dostatečného počtu terénních kmenů viru pocházejících z různých klinických forem onemocnění PCVD může zodpovědět tuto otázku. Exprese těchto čtecích rámců bude monitorována izolací kmenů viru na buněčné linii PK-15 a následně sledováním expresemRNA kvantitativní RT-PCR a 2D elektroforézou. Schopnost těchto kmenů viru indukovat apoptózu bude použita jako metoda kvantifikace virulence. Exprerse těchto čtecích rámců během přirozené infekce bude pravděpodobně doprovázena tvorbou specifických protilátek. proto plánujeme expresi všech pravděpodobných malých čtecích rámců a sledování nástupu sérokonverze a korelaci mezi touto sérokonverzí a nástupem protektivní imunitní odpovědi. Dále bude role malých čtecích rámců posuzována pomocí infekčních molekulárních klonů s deletovanými start kodony (nebo inkorporovanými stop kodony) malých čtecích rámců. Markerem virulence bude schopnost vyvolat klinickou formu onemocnění.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
CEP - another secondary branch
GJ - Diseases and animal vermin, veterinary medicine
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases<br>40301 - Veterinary science
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The results of this project have contributed to the understanding and analysis of small reading frames of circovirus PCV2 and exclusion of their role in circomavirus diseases in pigs. A possible factor of these infections is probably the co-infection with TT swine virus.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2012
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2012
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP13-GA0-GA-U/02:3
Data delivery date
May 17, 2016
Finance
Total approved costs
3,508 thou. CZK
Public financial support
3,508 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK