Interactions of disulfide groups in peptide/ protein molecules - complementary use of electronic and vibrational optical activity
Project goals
We will study impact of mutual interactions of disulphide groups in peptides and proteins. We would like to verify already established relationship between disulphide geometry and chiroptical properties (electronic circular dichroism - ECD and Raman optical activity - ROA) under the circumstances when more than one disulphide group is present in a molecule. Moreover, possibility to detect and conformationally analyze disulphide groups in a presence of amide groups will be evaluated. We also plan to investigate magnitude of mutual interactions in electronic spectra (number of dichroic bands and their splitting) and possibilities and limitations of observation of individual disulphide groups on the basis of C-S and S-S- stretching vibrational bands in Raman and particularly ROA spectra.
Keywords
disulphidegroupopticalactivityconformationcirculardichroismRamanopticalactivity
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)
Main participants
Univerzita Karlova / Matematicko-fyzikální fakulta
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P205-10-1276
Alternative language
Project name in Czech
Interakce disulfidových skupin v molekulách proteinů a peptidů - komplementární užití elektronové a vibrační optické aktivity
Annotation in Czech
Budeme studovat vliv vzájemných interakcí disulfidových skupin v molekulách peptidů a proteinů. Ověříme platnost již dříve námi nalezených vztahů mezi geometrií disulfidové skupiny a chiroptickými vlastnostmi (elektronovým cirkulárním dichroismem - ECD a optickou aktivitou v Ramanových spektrech – ROA) v situacích, kdy je v molekule přítomna více nežli jedna taková skupina. Vyhodnotíme možnost detekce a konformační analýzy disulfidových skupin v přítomnosti skupin amidových. Prostudujeme velikost vzájemných interakcí v elektronových spektrech (počet dichroických pásů a jejich štěpení) a možnosti a limitace separátního pozorování jednotlivých disulfidových skupin pomocí pásů C-S a S-S valenčních vibrací v Ramanových a zejména ROA spektrech.
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The aim and objectives of the project have been met. The project achieved significant results in the study of the interactions of disulphide groups in peptides and proteins. The involvement of two doctoral students is beneficial. The results were published in three papers in journals. Publication outputs are adequate for the size of the project and the number of members of the research team.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2010
Realization period - end
Jan 27, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GA-U/01:2
Data delivery date
Sep 30, 2017
Finance
Total approved costs
2,241 thou. CZK
Public financial support
2,241 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
2 241 CZK thou.
Public support
2 241 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
BO - Biophysics
Solution period
01. 01. 2010 - 27. 01. 2014