Development of high-resolution methodology for NMR studies of disordered proteins with highly degenerated resonance frequencies
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P206-11-0758
Alternative language
Project name in Czech
Vývoj metodologie s vysokým rozlišením pro NMR studie neuspořádaných proteinů s vysoce degenerovanými rezonančními frekvencemi
Annotation in Czech
Popis fyzikálního a chemického chování nestrukturovaných proteinů je důležitý pro pochopení procesu skládání proteinu v živé buňce. Mnohé proteiny jsou navíc přirozeně neuspořádané ve své fyziologické formě a hrají důležitou roli v různých patologickýchprocesech. Nukleární magnetická resonance (NMR) je velmi vhodná pro studium neuspořádaných proteinů, ale standardní NMR metody neposkytují dostatečné rozlišení pro některé aplikace. Předkládáme plán vyvinout sérii NMR experimentů s vysokým rozlišením, dosaženým přímou uhlíkovou detekcí, neuniformním vzorkováním a vysokou dimenzionalitou měřených spekter. Tyto metody umožní studovat zbytkové strukturní rysy a vnitřní pohyby neuspořádaných proteinů s vysokou degenerací frekvencí, typickou např. pro vysocerepetitivní struktury.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CB - Analytical chemistry, separation
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
BO - Biophysics
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10406 - Analytical chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project objectives were fully met. Methodology of multidimensional NMR experiments for analyses (resonant frequency assignment and determination of residual dipolar couplings) of intrinsically disordered proteins was developed. The methodology was used in the characterization of some important substances and their dynamics was studied. Investigator made an error in reporting of publications.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 12, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP14-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 1, 2014
Finance
Total approved costs
3,588 thou. CZK
Public financial support
3,588 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK