Structural and functional determinants on TRPV channels

Provider

Czech Science Foundation

Programme

Standard projects

Call for proposals

Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)

Main participants

—

Contest type

VS - Public tender

Contract ID

P301-10-1159

Project name in Czech

Strukturní a funkční determinanty na TRPV kanálech

Annotation in Czech

Rodina kanálů transient receptor potential (TRP) se skládá z hlavních rodin TRPV, TRPC, TRPM a TRPA1, které mají podobnou strukturu. Cytoplazmatické N a C-kjonce jsou odděleny 6 predikovanými transmembránových doménami (TM1-6), včetně póru mezi TM5-6. Kanály jsou regulovány ligandy jako jsou kalmodulin (CaM) a fosfatidyl-4,5-bi fosfát (PIP2). Cíle projektu: Určit vazebná místa  pro CaM na intracelulárních N- a C-koncích kanálů TRPV2,3,5 a na N-konci TRPV4 a pro PIP2 na obou koncích  u TRPV2,3,4,6 a na N-konci TRPV1,5. Fůzní proteiny různé délky N- a C-konců budou získány na studie fluorescenční spektroskopií. Dalším cílem studie je určení úlohy jednotlivých aminokyselinových zbytků v procesu otvírání a zavírání kanálů TRPV2,3,4 v oblasti mezi TM5-6  včetně póru. Homologní model TRPV kanálu bude vytvořen na základě struktury KcsA kanálu k potvrzení elektrofyziologických dat na TRPV2,3,4 a jejich mutantech.

R&D category

ZV - Basic research

CEP classification - main branch

CE - Biochemistry

CEP - secondary branch

EB - Genetics and molecular biology

CEP - another secondary branch

BO - Biophysics

OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30101 - Human genetics

Provider evaluation

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Project results evaluation

This project was focused on studying structure-function relationships of selected ion chanels of TRP family, which play an important role in nociception, temperature and chemicals sensation. Using site directed mutagenesis the researchers elucidated therole of a number of amino acid residues in interaction with ligand and binding partners; results were published in 9 articles with impact factor.

Realization period - beginning

Jan 1, 2010

Realization period - end

Dec 31, 2014

Project status

U - Finished project

Latest support payment

Mar 31, 2014

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP15-GA0-GA-U/01:1

Data delivery date

May 22, 2015

Total approved costs

5,130 thou. CZK

Public financial support

5,130 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK