Study of the interaction of C- and N- terminal segments of TRPV1 and TRPV3 channels with phospholipids.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 10 (SGA02010GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P205-10-P308
Alternative language
Project name in Czech
Studium interakcí C- a N- koncových segmentů receptorů TRPV1 a TRPV3 s membránovými fosfolipidy.
Annotation in Czech
TRPV1 a TRPV3 jsou členové TRP rodiny iontových kanálů. Tyto polymodální kanály jsou regulovány řadou podnětů. Poměrně nedávno byly do skupiny možných modulátorů aktivity těchto iontových kanálů zařazeny membránové fosfolipidy jako je fosfatidylinositol4,5-bisfosfat (PI(4,5)P2). Lokalizace těchto vazebných míst na TRPV1 a TRPV3 receptorech nebyla doposud určena. Cílem toho projektu je studovat oblast vazebného místa pro PI(4,5)P2 na cytoplazmatických C- a N- terminálních segmentech TRPV1 a TRPV3 receptorů s využitím fluorescenční spektroskopie a homologních počítačových modelů vytvořených na základě podobnosti s K+ kanálem a kanálem otevíraným cyklickými nukleotidy. Pro získání dostatečného množství rozpustné fúzní bílkoviny bude vytvořena řada konstruktů cytoplazmatických C- a N- terminálních segmentů různých délek. Tento projekt nám umožní pochopit regulaci TRPV receptorů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The set of TRP protein constructs was created. PIP2 binding site was in TRPV1 N-terminal region and two independent sites in C-terminus were identified and characterized. 4 papers in journal with high impact factor were dedicated to the project and 8 posters were presented at international conferences.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2010
Realization period - end
Dec 31, 2012
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2012
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP13-GA0-GP-U/03:3
Data delivery date
May 2, 2016
Finance
Total approved costs
1,218 thou. CZK
Public financial support
1,218 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK