Structural and functional determinants on TRPM5 and TRPM8 channels
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 7 (SAV02007-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
IAA600110701
Alternative language
Project name in Czech
Strukturní a funkční determinanty na kanálech TRPM5 a TRPM8
Annotation in Czech
Cílem tohoto projektu je charakterizace sekundárních struktur N? a C? intracelulárních konců TRPM5 a TRPM8 kanálů pomocí různých spektroskopických metod jako je cirkulární dichroismus, fluorescenční a Ramanova spektroskopie. Dále určit vazebná místa prokalmodulin na obou koncích těchto kanálů. Připravit řadu fúzních proteinů s různou délkou N- a C- konců obou kanálů. Lokalizovat selektivní filtr v kličce mezi pátou a šestou transmembránou doménou TRPM5 a TRPM8 kanálu. Dále zjistit úlohu jednotlivých aminokys. zbytků v dolní části alfa-helixu šesté transmembránové domény obou kanálů při procesu otevírání kanálů pomocí elektrofyziologických měření v přechodně transfekovaných HEK293 buňkách. Experimentálně získaná data na nativních a mutovaných na obou kanálech budou korelována s homologními modely vytvořenými na základě molekulárně dyn. simulace s krystalickými strukturami bakteriálního draslíkového kanálu KcsA nebo živočišného draslíkového kanálu Shaker K.v1.2 sloužících jako templát.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
ED - Physiology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
BO - Biophysics
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30105 - Physiology (including cytology)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
ATP and calmodulin binding sites on C-tail of TRPV1 channel were described. Similarly were identified calmodulin binding sites on C-tails of TRPC6,TRPV2 and TRPV5.Transmembranedomains and on C-tail of TRPA1 channel contributing to gating were determined.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2007
Realization period - end
Dec 31, 2011
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 18, 2011
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP12-AV0-IA-U/02:2
Data delivery date
Jun 28, 2013
Finance
Total approved costs
3,072 thou. CZK
Public financial support
3,072 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK