Formation of splicing machinery in the context of the cell nucleus
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P302-11-1910
Alternative language
Project name in Czech
Formování sestřihového aparátu v kontextu buněčného jádra
Annotation in Czech
Buněčné jádro obsahuje mnoho dynamických struktur, ale velmi málo je známo o molekulárních mechanismech, které určují jejich formování. V tomto návrhu plánujeme charakterizovat molekulární mechanismy, které spojují sestřih pre-mRNA s morfologií dvou jaderných kompartmentů - Cajalových tělísek (CT) a sestřihových kompartmentů (SK). Konkrétně se zaměříme na molekulární signály, které jsou důležité pro akumulaci sestřihových ribonukleoproteinových částic (snRNP) do CT. Dále chceme zjistit, které kroky přiformování snRNP jsou esenciální pro vznik CT. Paralelně budeme analyzovat dynamiku formování sestřihového komplexu in vivo a sledovat jak ovlivňuje strukturu SK. Tato měření budeme provádět pomocí fluorescenční mikroskopie na živých buňkách (FCS, FRAP,FRET) a nové technologie, která pomocí DNA rekombinace umožňuje označit jednotlivé bílkoviny pomocí fluorescentních značek v přirozeném genovém kontextu. Tyto přístupy umožňují neinvazivní zkoumámání jaderných procesů a zároveň zmenšují nebezpečí nefyziologické exprese značených bílkovin a s ním spojené tvorby artefaktů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EA - Morphology and cytology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Main result of this project is the finding that Cajal bodies can be induced in cells that normally lack these nuclear structures. For the first time we defined conditions that trigger formation of the Cajal body. Project contributed to study diseases like amyotrophic lateral sclerosis and retinitis pigmentosa. The results were presented in 5 scientific articles published in journals with IF.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 31, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
May 22, 2015
Finance
Total approved costs
6,045 thou. CZK
Public financial support
6,045 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK