Development of CpG methylation of HIV-1 promoter and its stabilizing effect on the latent provirus reservoir: longitudinal study in patients
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P304-12-1736
Alternative language
Project name in Czech
Vývoj methylace CpG promotoru HIV-1 a její vliv na stabilizaci latentního rezervoáru proviru: longitudinální studie u pacientů
Annotation in Czech
Latence proviru HIV-1 v rezervoáru znemožňuje eliminaci HIV-1 infekce u pacientů pomocí antivirové léčby. Methylace DNA oblastí retrovirového promotoru a enhanceru, umístěných v repetici na 5' konci (5' LTR), je jedním z mechanizmů zajišťujících udržení latence u pacientů. V předchozí práci jsme prokázali, že methylace CpG v 5' LTR HIV-1 zvyšuje rezistenci latentního HIV-1 vůči reaktivaci a tak určuje stabilitu latence viru HIV-1 (Blazkova et al., 2009). Nicméně ani hustá methylace 5' LTR HIV-1 nepotlačuje úplně reaktivaci HIV-1 při použití některých inhibitorů histon deacetyláz a buněčných aktivátorů. V klinické longitudinální studii se chceme zabývat dynamikou methylace CpG HIV-1 přímo v latentním rezervoáru pacientů a chceme určit schopnost reaktivace tohoto rezervoáru ex vivo. Konkrétní cíle naší práce jsou charakterizace vývoje methylace CpG HIV-1 v latentním rezervoáru pacientů během antiretrovirové léčby a charakterizace vlivu methylace CpG na stabilitu tohoto rezervoáru vůči reaktivaci. Tato klinická studie se zabývá možnými terapeutickými strategiemi eliminace HIV-1.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project treats actual topic of latent HIV-1 reservoir. The second goal of three main ones has not been solved - there were no appropriate patients in study group. There were no publications after 3 years of the project. Delayed final report included only one publication with IF = 4.54.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Apr 7, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
3,885 thou. CZK
Public financial support
3,885 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK