The role of DNA methylation and histone modifications in the establishment and maintenance of HIV-1 latency
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 8 (SGA02008GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
204/08/P616
Alternative language
Project name in Czech
Úloha methylace DNA a modifikace histonů při ustavení a udržení latence HIV-1
Annotation in Czech
Znalost molekulárních mechanismů latence viru HIV je zásadní pro eradikaci HIV-1 infekce. Objevili jsme, že CpG methylace 5?LTR není nezbytná pro ustavení latence HIV-1, ale kontroluje stabilitu transkripčního umlčení. Ukázali jsme, že latence viru HIV-1spojená s hypomethylací 5?LTR koreluje se snadnou reaktivovatelností proviru a je pravděpodobně zajištěná strukturou chromatinu v oblasti 5?LTR. Naproti tomu, vysoká úroveň methylace 5?LTR HIV-1 koreluje s rezistencí proviru vůči reaktivaci. V této práci budeme analyzovat (i) modifikace chromatinu v oblasti 5?LTR, jakožto možný mechanismus ustavení latence v buněčných liniích představujících různé stavy transkripce HIV-1; (ii) proporci methylovaných provirů v latentním reservoáru osob infikovaných virem HIV-1 a jeho aktivovatelnost za použití různých aktivátorů; (iii) význam interakce mezi 5? a 3?LTR pro latenci HIV-1. Studiem mechanismů spojených se stabilitou latentního reservoáru směřujeme k určení nových terapeutických cílů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Solution project was on schedule in terms of both professional and innovative use of funds.
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 3, 2008
Realization period - end
Sep 1, 2010
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 16, 2010
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP11-GA0-GP-U/04:3
Data delivery date
Mar 20, 2015
Finance
Total approved costs
1,500 thou. CZK
Public financial support
1,500 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK