All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

The Ras superfamily of GTPases and the evolution of the eukaryotic cell

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)

  • Main participants

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    P305-10-0205

Alternative language

  • Project name in Czech

    Nadrodina Ras GTPáz a evoluce eukaryotické buňky

  • Annotation in Czech

    Nadrodina Ras GTPáz zahrnuje ústřední složky mnoha významných drah v eukaryotické buňce a hraje roli ve vážných lidských chorobách, ale její celková sekvenční a strukturní diverzita a evoluce zůstávají v podstatě neprobádány. Tento projekt staví na současném pokroku v genomovém sekvenování a metodách bioinformatiky a fylogenetiky a má za cíl podrobnou evoluční a sekvenční analýzu nadrodiny Ras GTPáz u eukaryot. Pro analýzy využijeme sekvenční data z veřejných databází a z probíhajících genomových projektů pro jednobuněčná eukaryota Bigelowiella natans, Guillardia theta a Mastigamoeba balamuthi. Rozsáhlý taxonomicky bohatý datový soubor podrobíme detailní analýze sekvencí a proteinových struktur. Podrobnou fylogenetickou analýzou vymezíme evoluční vztahy v rámci nadrodiny a její zrekonstruovanou evoluční historii porovnáme s hlavními událostmi v evoluci eukaryot a eukaryotické buňky. Vybudujeme rovněž internetový portál umožňující přístup vědecké komunitě k datovým souborům a nástrojům vyvinutým v rámci projektu.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    EB - Genetics and molecular biology

  • CEP - secondary branch

  • CEP - another secondary branch

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

  • Project results evaluation

    Project provided insight not only about Ras superfamily GTPases and their diversity and evolution, but also about more general aspects concerning the evolution of the eukaryotic cell. Very successful project. Original aims were mostly achieved and the results were published in 5 papers in impacted journals with dedication to the project and 3 additional publications without grant dedication.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2010

  • Realization period - end

    Dec 31, 2012

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Apr 1, 2012

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP13-GA0-GA-U/02:3

  • Data delivery date

    May 17, 2016

Finance

  • Total approved costs

    1,737 thou. CZK

  • Public financial support

    1,737 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK