Regulation of hematopoietic stem cell differentiation by chromatin remodeling SWI/SNF2 ATPase Smarca5 (Snf2h) in mouse.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P305-12-1033
Alternative language
Project name in Czech
Regulace liniové determinace krvetvorné kmenové buňky chromatin-remodelačním enzymem Smarca5 (Snf2h) v myším modelu.
Annotation in Czech
Remodelace chromatinu se účastní transkripce, replikace a genové opravy mechanismy posunu DNA vůči histonovému oktameru eventuelně odstraněním/sestavením nukleosomu. Klíčový chromatin remodelační faktor Smarca5 (Snf2h), jež se účastní obou mechanismů, je nepostradatelný pro diferenciaci krvinek (Stopka 2000, 2003) a jeho delece metodou gene knockout (KO) v myši blokuje zahájení gastrulace (Stopka 2003). Vytvořili jsme následně myší model kondiciální inaktivace Smarca5 (cKO). Naše předběžné výsledky ukazují, že ztráta Smarca5 v krvetvorných buňkách vede k bloku diferenciace a liniové determinace kmenových buněk (vedoucí k jejich přežívání) s rozvojem těžké anemie a letality embrya den E18. Globální expresní profil ukazuje dysregulaci diferenciace a klíčových signálních drah. Delece Smarca5 v krevních subtypech (lymfocytech, myeloidních a erytroidních buňkách) vede k bloku jejich maturace (bez embryonální letality). Výzkum (využívající také tamoxifenem regulované CreExpresory) je zaměřen na pochopení role chromatinové struktury v biologii kmenových buněk a krvetvorných progenitorů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
FD - Oncology and haematology
CEP - another secondary branch
ED - Physiology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project resulted in an important advancement of knowledge on the role of ISWI ATPase Smarca5 in regulation of chromatin structure in hematopoesis and cellular differentiation. A large set of fundamental results was obtained and published in high level journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 17, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
14,550 thou. CZK
Public financial support
14,550 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK