Alternative isoforms of lysine demethylases in development and disease
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-19779S
Alternative language
Project name in Czech
Alternativní izoformy lyzin demetyláz ve vývoji a nemoci
Annotation in Czech
Histonové modifikace jsou nezbytné pro správnou funkci chromatinu a nesprávné hladiny těchto epigenetických značek často vedou k vývojovým vadám a nemoci. Proteiny mající schopnost modifikovat histony jsou proto intenzivně studovány a molekulární mechanismy jejich působení jsou již dobře prozkoumány. Málo pozornosti bylo však věnováno alternativním izoformám chromatin modifikujících proteinů. V navrhovaném projektu se zaměříme na KDM2A a KDM2B, doposud jediné dvě lyzin demetylázy, pro které byla popsána alternativní izoforma, které chybí N-koncová demetylázová doména. Budeme charakterizovat tyto alternativní izoformy, jejich promotory, proteinové partnery a cílové geny. Jelikož KDM2A, KDM2B a jejich alternativní izoformy vykazují vysoké hladiny exprese v myších embryonálních kmenových buňkách a během jejich diferenciace, použijeme kromě standardních lidských a myších buněčných linií myší kmenové buňky jako náš modelový systém. Navrhovaný projekt tak přispěje k objasnění molekulárních mechanismů, které stojí za pluripotencí a difefenciací kmenových buněk.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10601 - Cell biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EA - Morphology and cytology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
PI of the project described original results of promoter analysis, target specificity and deletion analysis of demethylase alternative isoforms KDM2A/B. However, most of the results, with exception of KDM2A/B effect on wnt signalling, remain unpublished. The project can be regarded as fulfilled, despite the incomplete publication of results. The use of project funds was in accordance with rules.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 12, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-U
Data delivery date
Jun 29, 2022
Finance
Total approved costs
7,476 thou. CZK
Public financial support
7,407 thou. CZK
Other public sources
69 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK