Characterization of the mitoproteome of the parasitic protist Trypanosoma brucei by means of recombinogenic engineering
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P305-12-2261
Alternative language
Project name in Czech
Charakterizace mitoproteomu parazitického prvoka Trypanosoma brucei metodou rekombinírování
Annotation in Czech
Studium jediné mitochondrie v buňce závažného parazita Trypanosoma brucei odhalilo řadu zvláštností, jako je rozsáhlá síť mitochondriální (mt) DNA, extrémně složitý metabolismus RNA zahrnující známé editování RNA. Během životního cyklu se plně funkčníhoorganela ve stádiu v hmyzím vektoru změní na velmi redukovanou mitochondrii, charakteristickou pro patogenní stádium v krvi savčího hostitele. Série kroků vedoucích k expresi mt genů vyžaduje časovou a prostorovou koordinaci, o níž však dosud není nic známo. Podobně zatím nebyl studován mitoproteom přechodného stádia. Pro zodpovězení těchto a dalších otázek chceme označit fluorescenční značkou až 200 mt bílkovin, což prostřednictvím nejmodernějších metod rekombinantní technologie a mikroskopie s vysokýmrozlišením umožní určit jejich suborganelární lokalizaci a případné rozdíly mezi životními stádii. Cílem tohoto projektu je rovněž vytvořit efektivní platformu pro zodpovídání otázek týkajících se funkcí více než poloviny bílkovin tvořících proteom T. brucei, o nichž dosud není nic známo.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The goal of the project was the investigation of mitoproteome of a model organism Trypanosoma brucei using a protein fluorescent tagging to determine their sub-organellar localization. Experimental difficulties lead to rephrasing of the project to a smaller set of mitochondrial proteins. This approach was well justified and resulted in publication of 7 original papers in impacted journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 31, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
May 22, 2015
Finance
Total approved costs
4,682 thou. CZK
Public financial support
4,085 thou. CZK
Other public sources
597 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK