HMGB proteins: involvement in biology of telomeres and human embryonic stem cells
Project goals
Recently we have observed that deficiency of chromosomal HMGB1 protein (involved in transcription, DNA repair, genomic stability and cellular signaling) in mouse fibroblasts resulted in significant decrease in telomerase activity, shortening of telomere length and chromosome aberrations. Here we propose to study the impact of deregulated expression of HMGB1 or other HMGBs (silencing by shRNA or plasmid-directed over-expression) in stably transfected human embryonic stem cells (hESCs). As HMGB1 expression becomes down-regulated upon entry of hESCs into differentiation pathway, we will address the possible involvement of HMGBs in maintenance of the key property of stem cells - pluripotency. We also intend to study the involvement of HMGBs in modulation of telomerase activity, telomere functioning and genomic stability. This project is based on rather distant fields of molecular and biomedical sciences, and it is expected to produce results of basic research which may also be relevant to biomedical application of hESCs which is often limited by genetic instability of the stem cells.
Keywords
HMGBproteinschromatintelomeresgenomicstabilitypluripotencydifferentiationhumanembryonicstemcells
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Masarykova univerzita / Lékařská fakultaContest type
VS - Public tender
Contract ID
P305-12-2475
Alternative language
Project name in Czech
Proteiny HMGB: funkce v biologii telomer a lidských embryonálních kmenových buněk
Annotation in Czech
Nedávno jsme prokázali, že inhibice exprese chromozomálního proteinu HMGB1 (významný pro transkripci, reparaci DNA, genomovou stabilitu a buněčnou signalizaci) vede u myších fibroblastů k významnému poklesu aktivity telomerázy, zkrácení telomer a chromozomovým aberacím. V tomto projektu navrhujeme studovat cílenou deregulaci exprese proteinů HMGB (útlum vlivem shRNA nebo zvýšení exprese vlivem plazmidu) v stabilně transfekovaných lidských embryonálních kmenových buňkách (hESCs). Vzhledem k tomu, že v průběhu diferenciace hESCs dochází k útlumu exprese HMGB1, budeme sledovat vliv deregulace exprese HMGB1 (popř. jiných proteinů rodiny HMGB) na zachování klíčové vlastnosti kmenových buněk - pluripotence. Dále budeme studovat vliv proteinů HMGB na aktivitu telomerázy, strukturu/funkci telomer a genomovou stabilitu. Navrhovaný projekt je založen na spojení relativně odlišných oblastí základního výzkumu v oblasti molekulární a lékařské biologie s cílem získat výsledky nejen základního výzkumu, ale i pro možné využití v medicíně, které je často limitováno genetickou nestabilitou hESCs.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project has proceeded according to the planned specific objectives. The main results related the role HMGB1 and HMGB2 on human embryonic stem cells have not been published, yet. The PI has acknowledged this grant in 3 publications.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 10, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Sep 25, 2017
Finance
Total approved costs
9,740 thou. CZK
Public financial support
9,740 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
9 740 CZK thou.
Public support
9 740 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
EB - Genetics and molecular biology
Solution period
01. 01. 2012 - 31. 12. 2015