Genome reunions in plants: from DNA to chromosomes and reverse
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P501-10-0208
Alternative language
Project name in Czech
Genomová spojení u rostlin: od DNA ke chromosomům a zpět
Annotation in Czech
Většina vyšších rostlin včetně hospodářsky významných plodin jako jsou pšenice, káva, řepka vznikla mezidruhovou hybridizací spojenou s následnou multiplikací rodičovských chrosomálních sad, t.j. procesem allopolyploidie. Předmětem výzkumu bude studium genetických změn indukovaných allopolyploidií u modelových organismů různého stáří a typu. Strukturní polymorfismy homeologních (partnerských) chromosomů jsou důležitými parametry ovlivňujícími meiotickou stabilitu allopolyploidního jádra a tím i fenotyp.Pozornost bude zaměřena na repetitivní sekvence DNA, které tvoří podstatnou část chromosomů, a které podléhají rychlé evoluci.Velké množství dat generovaných plošným sekvenováním umožní řešit klíčové otázky, jako například které části genomu podléhají rychlým změnám (delece, konverze, rekombinace, transpozice) a které zůstávají naopak neměnné. Budou dále zkoumány epigenetické faktory (například metylace DNA), které ovlivňují stabilitu repetitivní DNA v jádře. Navrhované výzkumné směry přispějí k našimpoznatkům o chování genomu v průběhu allopolyploidie a získané zkušenosti mohou být perspektivně využity ve šlechtitelských programech a biotechnologiích.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
GE - Plant cultivation
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
BO - Biophysics
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Final report is carefully written and contains all required information. The project was executed at excellent level and lead to novel results on the dynamics of changes in parental genomes in allopolyploid plant species. The project supported educationof PhD students (3 defended Thesis) and its results were published in 13 scientific journals with impact factor and on scientific conferences.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2010
Realization period - end
Dec 31, 2012
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2012
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP13-GA0-GA-U/02:3
Data delivery date
May 17, 2016
Finance
Total approved costs
2,973 thou. CZK
Public financial support
2,973 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK