Functional role of oxysterols in plant photosynnthesis
Project goals
Small molecule enzyme activators enable us to better understand the endogenous principles of enzyme activation and their allosteric mechanisms. To activate an enzyme, they often bind to an allosteric site at the catalytic domain of the enzyme or to its regulatory subunit, leading to a conformational change. Using affinity chromatography of plant extracts with carriers prepared by oriented immobilisation of oxysterol ligands (ecdysteroids, brassinosteroids), we identified a range of proteins able to bindthese compounds. We already proved the regulatory effect of oxysterols on some of these proteins (RuBisCO, OEC, glutathione-S-transferase), and found the oxysterol-binding site in other photosynthetic enzymes as well. We intend to confirm the role of oxysterols in activation or fine tuning of these enzymes, and describe the mechanisms of these processes. To identify the binding sites and to explain activity changes, both in vivo and in vitro methods will be used (measurement of photosynthetic parameters, co-crystalisation of proteins in presence of activators, computational modelling)
Keywords
photosynthesisRuBisCOenzymeactivatoroxysterolecdysteroidsbrassinosteroids
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P501-11-1650
Alternative language
Project name in Czech
Funkční úloha oxysterolů ve fotosynthese rostlin
Annotation in Czech
Nízkomolekulární aktivátory enzymů umožňují poznat principy endogenní regulace enzymových aktivit a jejich allosterických mechanismů. Enzymovou aktivitu ovlivňují nejčastěji vazbou na allosterické místo katalytické domény enzymu, nebo vazbou na regulačnípodjednotku a indukcí konformační změny. Affinitní chromatografií rostlinných extraktů na nosičích připravených orientovanou imobilizací oxysterolových ligandů (ekdysteroidy, brassinosteroidy) jsme identifikovali řadu bílkovin schopných vázat tyto sloučeniny. Podařilo se nám prokázat regulační účinky oxysterolů na některé z těchto bílkovin (RuBisCO, OEC, glutathion-S-transferasu aj.) a zjistili jsme přítomnost vazebných míst pro oxysteroly i u dalších fotosyntetických komplexů. Cílem projektu je potvrdit úlohu oxysterolů jako sloučenin odpovědných za aktivaci či jemnou regulaci těchto bílkovin a vysvětlit mechanismus jejich účinku. K identifikaci vazebných míst a k vysvětlení změn aktivity budou použity metody in vivo i in vitro (měření různých fotosyntetických parametrů, kokrystalizace bílkovin s aktivátory, počítačové modelování).
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
GC - Plant growing, crop rotation
CEP - another secondary branch
EF - Botany
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10611 - Plant sciences, botany
10612 - Mycology
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Project focusing on the study of a role of oxysterols in plant photosynthesis fullfiled expected goals. The outputs of the project are 2 high quality papers in the journal Steroids, one additional paper in an impacted journal and two papers in conferenceproceedings.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 28, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
May 22, 2015
Finance
Total approved costs
5,850 thou. CZK
Public financial support
5,850 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
5 850 CZK thou.
Public support
5 850 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
CE - Biochemistry
Solution period
01. 01. 2011 - 31. 12. 2014