Molecular evolution of Arsenophonus, an emerging group of symbiotic bacteria with a broad host distribution
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P505-10-1401
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární evoluce rodu Arsenophonus, symbiotických bakterií s širokým hostitelským spektrem
Annotation in Czech
Projekt studuje systematickým a komplexním přístupem fylogenezi a evoluci rychle rostoucí skupiny vnitrobuněčných symbiontů hmyzu, bakteriálního rodu Arsenophonus. Prostřednictvím kombinace metod molekulární fylogenetiky, populační genetiky, srovnávací genomiky a vizualizace založené na molekulárních markerech (fluorescenční in situ hybridizace ? FISH) řeší hlavní problémy, které vyvstávají ze současné neucelené znalosti evoluce rodu Arsenophonus a jeho vztahu k hostitelům. Cíle projektu jsou: 1) Multigenové analýzy fylogenetických paternů. Tato část projektu se věnuje především vztahům mezi liniemi arsenofonů s různými životními strategiemi (paraziti, komensálové, mutualisti) a vyhledávání nových linií se zřetelem na geografické rozšíření a hostitelskou specifitu. 2) Mapování distribuce arsenofonů na genealogii hostitele s cílem posoudit hypotézy o koevoluci a mnohonásobném vzniku symbiozy. 3) Komparativní genomika založená na nově získané sekvenci genomu z modelové linie arsenofona. 4) Objasnění tkáňové lokalizace symbiontů v hostiteli s využitím metody FISH.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EH - Ecology - communities
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
EG - Zoology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The scientific level of obtained results is in close correlation with the total Impact Factor of 4 published papers, which was 48.9. The data in Final report agree with the obtained results and the results could be a basis for other host vers. microbiomeinteractions. The only imperfection of the Final report is very brief description of spent expenses.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2010
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 12, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP14-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 1, 2014
Finance
Total approved costs
5,451 thou. CZK
Public financial support
5,451 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK