Molecular evolution of Arsenophonus, an emerging group of symbiotic bacteria with a broad host distribution
Project goals
The project explores in a complex and systematic manner the phylogeny and evolution of rapidly growing group of insect-associated intracellular bacteria of the genus Arsenophonus. By combining methods of molecular phylogenetics, population genetics, comparative genomics, and molecular-markers-based method of visualisation (fluorescence in situ hybridisation ? FISH), it addresses the main questions that have arisen from the current fragmentary knowledge on the Arsenophonus evolution and its relation to the host. The aims of the project include 1) Multi-gene analyses of the phylogenetic patterns. This part of the project will focus on phylogenetic relationships among Arsenophonus lineages with different life strategies (i.e., parasites, commensals, mutualists) and screening for new lineages with respect to geography- and host-distribution. 2) Mapping of Arsenophonus distribution on the host?s genealogy with the aim to assess the coevolution vs. multiple-origin hypotheses. 3) Comparative genomics based on the new genome sequence from a model lineage of Arsenophonus. 4) FISH-based investigation of the symbiont location in the host tissues.
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P505-10-1401
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární evoluce rodu Arsenophonus, symbiotických bakterií s širokým hostitelským spektrem
Annotation in Czech
Projekt studuje systematickým a komplexním přístupem fylogenezi a evoluci rychle rostoucí skupiny vnitrobuněčných symbiontů hmyzu, bakteriálního rodu Arsenophonus. Prostřednictvím kombinace metod molekulární fylogenetiky, populační genetiky, srovnávací genomiky a vizualizace založené na molekulárních markerech (fluorescenční in situ hybridizace ? FISH) řeší hlavní problémy, které vyvstávají ze současné neucelené znalosti evoluce rodu Arsenophonus a jeho vztahu k hostitelům. Cíle projektu jsou: 1) Multigenové analýzy fylogenetických paternů. Tato část projektu se věnuje především vztahům mezi liniemi arsenofonů s různými životními strategiemi (paraziti, komensálové, mutualisti) a vyhledávání nových linií se zřetelem na geografické rozšíření a hostitelskou specifitu. 2) Mapování distribuce arsenofonů na genealogii hostitele s cílem posoudit hypotézy o koevoluci a mnohonásobném vzniku symbiozy. 3) Komparativní genomika založená na nově získané sekvenci genomu z modelové linie arsenofona. 4) Objasnění tkáňové lokalizace symbiontů v hostiteli s využitím metody FISH.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EH - Ecology - communities
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
EG - Zoology
10606 - Microbiology
10607 - Virology
10613 - Zoology
10614 - Behavioral sciences biology
10615 - Ornithology
10616 - Entomology
10618 - Ecology
10619 - Biodiversity conservation
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The scientific level of obtained results is in close correlation with the total Impact Factor of 4 published papers, which was 48.9. The data in Final report agree with the obtained results and the results could be a basis for other host vers. microbiomeinteractions. The only imperfection of the Final report is very brief description of spent expenses.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2010
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 12, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP14-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 1, 2014
Finance
Total approved costs
5,451 thou. CZK
Public financial support
5,451 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
5 451 CZK thou.
Public support
5 451 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
EH - Ecology - communities
Solution period
01. 01. 2010 - 31. 12. 2013