Evolution of DNA base composition in land plants
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P506-11-0890
Alternative language
Project name in Czech
Evoluce kompozice DNA bazí u vyšších rostlin
Annotation in Czech
Kompozice DNA bazí (GC obsah) je významnou genomickou a systematickou charakteristikou popisující zastoupení nukleotidů v genomu. GC obsah se může lišit v závislosti na různých strukturálních a funkčních vlastnostech genomů, jak je to známo především zestudií u bakterií a obratlovců. U rostlin je GCobsah znám jen u několika málo čeledí a ve většině skupin údaje naprosto chybí. Hlavními cíli tohoto projektu je dokumentovat rozdíly v GC obsahu a evoluční trendy jeho změny v rámci pěti hlavních skupin vyšších rostlin (mechorostů, plavuní, kapraďorostů, nahosemenných a krytosemenných). Zvláštní pozornost bude věnována testování možných ekologických a evolučních výhod spojených s vysokým nebo nízkým obsahem GC a standardizaci měření GC obsahu u rostlin.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project delt with an estimation of genomic GC content across all the lineages of higher plants. This survey documented the correlation between GC content and genome size or ecological parameters. The outstanding level of achieved results is confirmedby the papers in respected journals, including PNAS, where the PI is the first and corresponding author.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 19, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
May 22, 2015
Finance
Total approved costs
5,682 thou. CZK
Public financial support
5,682 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK