Phylogenetic and phenotypic evaluation of heterocytous cyanobacteria of the family Scytonemataceae.
Project goals
Cyanobacteria are important for numerous ecosystems over the world. The modern evaluation of their diversity is based on molecular methods combined with identification of autapomorphic phenotype markers, connected with their phylogenetic position. The applicant is author of European identification key (Elsevier Heidelberg). He is also the main author of the world internet database (www.cyanodb.cz), which is proposed as Approved list of cyanobacterial genera for bacteriological nomenclature. The family Scytonemataceae contains ecologically important species, but up to now less than 5% of species were studied by modern molecular methods. The main goal of this grant is to establish and explain the phylogenetic relations in genera and species within the family, particularly important for extreme ecosystems. These genera and species are also important for the understanding of cyanobacterial diversity, ecology and phylogeny. The result of this grant is publication of the review of revised scytonematacean genera and selected species and completing of the world database.
Keywords
CyanobacteriaScytonemataceaephylogenydiversityecologypolyphasicapproach
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P506-12-1818
Alternative language
Project name in Czech
Fylogenetické a fenotypové vyhodnocení heterocytózních cyanobakterií čeledě Scytonemataceae.
Annotation in Czech
Cyanobakterie představují rozsáhlou a významnou složku světových ekosystémů. Moderní hodnocení jejich diverzity je založeno na molekulárních metodách kombinovaných se stanovením autapomorfních fenotypových znaků. Navrhovatel je autorem třídílného evropského determinačního klíče se světovým přehledem cyanobakterií (Elsevier Heidelberg). Současně vede světovou internetovou databázi (www.cyanodb.cz) sloužící jako Approved list cyanobakteriálních rodů vyžadovaný pravidly bakteriologické nomenklatury. V minulých letech bylo vyhodnoceno přibližně 60% heterocytozních rodů moderními metodami a v jednotlivých rodech necelých 5% druhů. Úkolem grantu je zjistit fylogenetické vztahy zejména druhů z čeledě Scytonemataceae, které jsou významné hospodářsky a pro extrémní ekosystémy a které byly studovány zatím jen výjimečně. Rody této čeledě mají pro pochopení cyanobakteriální diverzity, ekologie a fylogeneze mimořádný význam. Cílem grantu je publikace revidovaného přehledu celé čeledě a doplnění světové databáze.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
EH - Ecology - communities
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10611 - Plant sciences, botany
10612 - Mycology
10618 - Ecology
10619 - Biodiversity conservation
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The aim of the project which was to provide a taxonomic revision of the cyanobacterial family Scytohemataceae, was achieved fully. Morphological or phylogenetic description was published for novel taxa or revised in the existing ones. In addition, thereare papers on ecology and a book. Among 12 IF journal papers (including one in press), 6 rank among to 25% and other 6 among top 50% in its field.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 19, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
May 22, 2015
Finance
Total approved costs
5,117 thou. CZK
Public financial support
5,117 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Recognised costs
5 117 CZK thou.
Public support
5 117 CZK thou.
0%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
EF - Botany
Solution period
01. 01. 2012 - 31. 12. 2014