High-resolution spatio-temporal control of the activation mechanism of DNA replication
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
International projects
Call for proposals
Mezinárodní projekty 8 (SGA0201300004)
Main participants
Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-12317J
Alternative language
Project name in Czech
Vysokorezoluční prostorově-časová analýza aktivačního mechanizmu DNA replikace
Annotation in Czech
Řada mechanizmů replikace DNA byla již do určité hloubky objasněna a mnoho replikačních faktorů bylo v buňce identifikováno. Nicméně syntetický pohled na replikaci je stále "v nedohlednu". Biochemické analýzy in vitro a genetické analýzy na kvasinkách umožnily identifikovat několik možných faktorů účastných v aktivaci replikace DNA. S použitím škály moderních mikroskopií a baterie márkrů/transfekovaných buněk bude proto v rámci buňky stanovena jak vysoko-rezoluční struktura replikačních míst, tak 4D „recruitment“ relevantních faktorů do těchto míst. Po identifikaci nejvhodnějších faktorů bude námi zavedená strategie subnukleárního cíleného směrování v živých buňkách využita k testování úlohy těchto faktorů při aktivaci replikačních počátků. Rovněž bude provedena manipulace rozmístění chromatinových domén a testován její vliv na aktivaci replikačních počátků i v souvislosti se změnami v epigenomu. Výsledky našeho bádání by měly přispět k prohloubení znalostí o strukturně-funkční dynamice replikačních procesů a aktivačním mechanizmu replikace na buněčné úrovni.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EA - Morphology and cytology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project brought new information on the structure of replication and transcription foci and exchange of DNA between nucleoli and nucleoplasm. Results have been published in three papers in journals with IF, further two manuscripts will be submitted.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Nov 24, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GC-U/01:1
Data delivery date
Jun 30, 2017
Finance
Total approved costs
8,578 thou. CZK
Public financial support
8,578 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK