Mapping mRNP-NUP interactions during nuclear export with a unique mRNA-trap

Project name in Czech
Mapování interakcí mRNP-NUP během jaderného exportu pomocí unikátního přístupu mRNA-trap
Annotation in Czech
Eukaryotické mRNA musí projít jadernými póry, aby dosáhly cytoplazmy. Studium exportu jaderné mRNA je obtí, jedná se totiž o rychlý proces a s transientními interakcemi. Naše výsledky ukazují, že trypanosomy postrádají checkpoint, který brání nezralým mRNA v zahájení jaderného exportu. V důsledku toho mohou být blokováním transkripce nebo sestřihu zachyceny celé komplexy mRNA a ribonukleoproteinů (mRNP) během exportu. V navrhovaném projektu plánujeme metodicky využít tuto jedinečnou vlastnost jako tzv. „mRNA trap“. Za využití proximitní biotinylace a klasických interaktomických přístupů tak vytvoříme zevrubnou mapu interakcí mezi proteiny jaderných pórů a mRNP během transportu. Navzdory velké diverzitě mezi skupinami eukaryot je základní struktura jaderného póru vysoce konzervovaná. Získaná data tak budou velmi pravděpodobně aplikovatelná na Opisthokonta. Na druhou stranu náš přístup slibuje odhalit aspekty v exportu mRNA, které jsou unikátní pro trypanosomy a umožní tak nejen posunout naše znalosti o evoluci tohoto procesu, ale i odhalit zranitelná místa metabolismu tohoto patogena.

R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology

Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GC-R
Data delivery date
May 21, 2024

Similar projects(10)