Chromatin associated factors involved in regulation of Arabidopsis 45SrDNA
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Junior Grants
Call for proposals
Juniorské granty 2 (SGA0201600002)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-04166Y
Alternative language
Project name in Czech
Chromatin asociované faktory podílející se na regulaci 45SrDNA v Arabidopsis
Annotation in Czech
Arabidopsis 45SrDNA je lokalizována na chromozomu 2 a 4. Existují minimálně 4 různé varianty 45SrDNA, které se exprimují v závislosti na stadiu vývoje rostliny. Stabilita 45SrDNA je narušena u fas mutantů (mutantů pro podjednotky chromatin assembly faktoru CAF1), u nichž se 45SrDNA systematicky ztrácí. Dle našich předběžných dat, tento efekt není možno zcela revertovat, ani po dlouhodobé propagaci rostlin ve WT genetickém pozadí. Kromě ztráty 45SrDNA dochází u fas mutantů ke stimulaci genů, které se účastní oprav DNA. 45SrDNA je také regulována epigeneticky nebo pomocí proteinů účastnících se homologní rekombinace. Cílem tohoto projektu bude dále rozšířit znalosti v oblasti udržování stability 45SrDNA. Budou analyzovány epigenetické změny u rostlin po reverzi z fas mutace, příspěvek vybraných chaperonů a kináz aktivovaných poškozením DNA k udržení stability 45SrDNA a rozložení H3 histonových variant v 45SrDNA lokusu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Project considerably contributed to elucidation of factors involved in 45S rDNA maintanance in Arabidopsis thaliana, including epigenetic changes associated with genome recovery after mutations in chromatin assembly factor CAF1. During 3 years of solution of this junior project 4 papers were published in high-standard journals, the other manuscript is in the final phase of review proces.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 16, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GJ-U/01:2
Data delivery date
Jun 11, 2019
Finance
Total approved costs
6,880 thou. CZK
Public financial support
6,880 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK