Reprogramming of epigenetic state of transgenic and endogenic loci during dedifferentiation and plant regeneration.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 11 (SGA02011GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P501-11-P667
Alternative language
Project name in Czech
Reprogramování epigenetického stavu transgenních a endogenních lokusů v průběhu dediferenciace a regenerace rostlin.
Annotation in Czech
Bylo prokázáno, že kalusová kultura je významným stresovým faktorem, který ovlivňuje epigenetický obraz genomu rostlin. Tento projekt zaměřujeme na výzkum podstaty a dynamiky kalusovou kulturou navozených změn epigenetického stavu transgenních lokusů i vybraných endogenních sekvencí. Cílem tohoto projektu bude 1) studovat epigenetickou stabilitu transgenního lokusu i endogenních repetic v průběhu dediferenciace a kultivace rostlinných buněk in vitro,2) stanovit aktivitu a změny epigenetického obrazu vybraných genů účastnících se epigenetických procesů v rostlinných tkáních, kalusech a z nich regenerovaných rostlin, 3) porovnat epigenetické změny transgenního lokusu vznikající de novo vlivem kalusové kultury se změnami vyvolanými interakcí s dalším transgenním lokusem s umlčovací aktivitou. Epigenetický stav bude hodnocen na obou úrovních:metylace DNA i modifikace histonů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Induction of DNA methylation of transgenic loci can lead to the significant and stable silencing of their expression without the simultaneous exchanges of histone marks associated with actively expressed loci for the marks associated with silenced loci.Students were not integrated. One paper was approved. Some results were not published yet.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 6, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GP-U/02:2
Data delivery date
May 6, 2016
Finance
Total approved costs
2,122 thou. CZK
Public financial support
2,122 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK