Structure and dynamics of 45S rDNA loci in Arabidopsis thaliana
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
KONTAKT II
Call for proposals
KONTAKT II 5 (SMSM2015LH5)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-32267/2015-1
Alternative language
Project name in Czech
Struktura a dynamika 45S rDNA lokusů v Arabidopsis thaliana
Annotation in Czech
Odborným cílem projektu je: 1) Popsat strukturu obou chromozomálních 45S rDNA lokusů z hlediska uspořádání aktivních a neaktivních variant 45S rDNA. Analyzovat proximální a distální hraniční oblasti 45S rDNA lokusů. 2) Zjistit, zda u fas mutant dochází k preferenční ztrátě některého z 45S rDNA lokusů, a jak se případně za těchto okolností chová druhý lokus. U revertantů akumulujících kopie rDNA obdobně zjistit, zda se lokusy chovají při akumulaci jako ekvivalentní či nikoli. 3) Identifikovat genetické a epigenetické faktory determinující diferenciální expresi a časování replikace variant 45S rDNA Strategickým cílem projektu je upevnění a prohloubení výzkumné spolupráce se špičkovým pracovištěm v USA, a tím i zvýšení kompetencí a konkurenceschopnosti v této oblasti základního výzkumu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Arrangement and sequence variability were clarified of active and silenced 45S rDNA variants. In plants with CAF-1 knock-out, the processes of the loss of individual variants and their recovery upon CAF-1 restoration were characterised. Genetic and epigenetic factors of differential expression and replication of rDNA variants were described. Spatiotemporal replication pattern of active rDNA was obtained at super-resolution level, devoid of the inactive rDNA replication pattern. Results were disseminated in 6 papers, 5 conference presentations, 1 dissertation and 1 diploma thesis.
Solution timeline
Realization period - beginning
Nov 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 2, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-MSM-LH-U/01:1
Data delivery date
Jun 7, 2018
Finance
Total approved costs
1,972 thou. CZK
Public financial support
1,972 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK