Unraveling genomic and geographical diversification during speciation in cyanobacteria
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Junior Grants
Call for proposals
Juniorské granty 5 (SGA0201900002)
Main participants
Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-12994Y
Alternative language
Project name in Czech
Genomická a geografická diversifikace v průběhu speciace sinic
Annotation in Czech
Diverzita organismů na Zemi čítá miliardy druhů a většina s nich se řadí mezi prokaryota. Nicméně procesy, které jsou zodpovědné za tuto ohromnou diverzitu, jsou z větší části neznámé. V rámci tohoto projektu bude zkoumat speciační procesy u celosvětově rozšířené nárostové sinice Microcoleus. V projektu použijeme nejmodernější sekvenační metody, abychom získali co nejkvalitnější genomy z populací nacházejících se v Evropě a USA. Tím bude zajištěna široká geografická distribuce populací. Zaměříme se na variabilitu strukturní i nukleotidovou v rámci genomů divergentních linií na geografickém gradientu. Tyto data nám pomohou přinést nové informace o dlouhotrvajících otázkách o roli geografické izolace v evoluci mikroorganismů. Následně budeme analyzovat divergenci a genový tok mezi jednotlivými liniemi (populacemi/druhy) v rámci celého genomu. Toto nám pomůže osvětlit mechanizmy zodpovědné za evoluci genomu na úrovni populací/druhů. Nakonec zrekonstruujeme historii vývoje velikosti populací a také genového toku mezi nimi.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EA - Morphology and cytology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Jun 30, 2022
Project status
—
Latest support payment
Apr 1, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GJ-R
Data delivery date
Jun 26, 2023
Finance
Total approved costs
3,925 thou. CZK
Public financial support
3,925 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK