Molecular mechanisms of bacterial survival in harsh conditions
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 14 (SGA0201300006)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-27150P
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární mechanismy přežití bakterií v nepříznivých podmínkách
Annotation in Czech
Bakterie zůstávají většinu svého života ve stacionární fázi. Adaptace na stacionární fázi je tudíž nezbytná pro jejich přežití a také pro přežití patogenních bakterií v hostitelích. Klíčovou regulační molekulou ve stacionární fázi je 6S RNA, která inhibuje RNA polymerázu v komplexu s primárním sigma faktorem a tím mění genovou expresi. 6S RNA dosud nebyla nalezena u mykobakterií, mezi něž patří významné lidské patogeny. Naším cílem je zjistit, jak je regulována transkripce během stacionární fáze růstu bakterie Mycobacterium smegmatis, která je příbuzná patogenním mykobakteriím. Zajímá nás, zda M. smegmatis využívá 6S RNA podobně jako jiné bakterie nebo mykobakterie používají jiný, dosud neznámý mechanismus regulace genové exprese nezávislý na 6S RNA. 6S RNA by mohla být nahrazena bílkovinami nebo jinými malými RNA - například Ms1 malou RNA, kterou jsme popsali nedávno. Buňky ve stacionární fázi přepisují obrovská množství této RNA a my bychom chtěli objasnit úlohu Ms1 při regulaci genové exprese během stacionární fáze růstu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
It was found that Ms1 RNA binds to RNA polymerase and is one of the major regulators of gene expression of mycobacteria. Ms-1 has also been shown to have no effect on the transcription of sigma A dependent genes. The output of the grant is one publication and two manuscripts. Ms1 is a potential target of antibiotics for the treatment of tuberculosis.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 5, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 12, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GP-U/03:1
Data delivery date
Jun 11, 2019
Finance
Total approved costs
2,578 thou. CZK
Public financial support
2,578 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK