Regulation of the embryonic stem cell pluripotency factor Oct4 via guanine quadruplex in its promoter
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 15 (SGA0201400003)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
14-33947P
Alternative language
Project name in Czech
Regulace faktoru embryonálních kmenových buněk Oct4 prostřednictvím guaninového kvadruplexu v promotoru
Annotation in Czech
Embryonální kmenové buňky (ES) představují svou schopností sebeobnovy a přeměny na jakýkoli buněčný typ slibný léčebný prostředek využitelný především v transplantační a regenerační medicíně. Tvorba ES vyžaduje aktivaci genu Oct4. Oct4 je regulován několika regulačními oblastmi, které jsou neobvykle bohaté na guanin, a tedy mohou potenciálně tvořit guaninové kvadruplexy. Tato místa jsou také cílem některých transkripčních faktorů, jako např. proteinu SAF-A. Pomocí UV spektroskopických metod, zejména cirkulárního dichroismu, elektroforetických metod, chemického a enzymatického sondování DNA a fluorescenčních technik budeme studovat, jakým způsobem se kvadruplex účastní regulace genu Oct4 a tedy vzniku a diferenciace ES buněk. Prostudujeme interakci G-bohaté regulační oblasti a dvou DNA-vazebných domén proteinu SAF-A, s cílem objasnění role kvadruplexu v této interakci; funguje kvadruplex jako konformační přepínač, podmíněný vazbou SAF-A a následně regulující expresi Oct4?
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10610 - Biophysics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project was solved on a satisfactory level and have brought new insight to regulatory properties of guanidine quadruplexes in the expression of oct4 gene. The results are of a broader international importance. The team published 2 articles in respected internationals, BBA (IF5.37) and Biochemie (IF3.01). Main goals were reached and panel evaluates the project as “accomplished”.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2014
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 17, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GP-U/01:1
Data delivery date
Jun 30, 2017
Finance
Total approved costs
1,505 thou. CZK
Public financial support
1,505 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK