NMR study of interaction of cisplatined G/T mismatched DNA substrate with protein MutS
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 8 (SGA02008GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
202/08/P416
Alternative language
Project name in Czech
Studium interakce mezi cisplatinovanou G/T "mismatched" DNA s proteinem MutS pomocí NMR
Annotation in Czech
Systém oprav mismatchů (MMR) DNA opravuje špatně spárované a nebo nespárované base stejně tak jako ostatní poruchy DNA, čímž hraje kritickou úlohu v prokaryotických a eukariotických buňkách při rozpoznání protinádorového léčiva cisplatiny. Předpokládá se, že tento systém způsobuje cytotoxicitu rozpoznáním poruch na DNA zapříčiněnými cisplatinou. V tomto projektu bude studována interakce mezi proteinem MutS a cisplatinovanou DNA. Jako hlavní fyzikálně chemická metoda pro popis této interakce na atomárníúrovni bude použita NMR. Za použití nejnovějších metod v oblasti NMR a molekulového modelování bude určena struktura complexu vzniklého interagujícími molekulami. Cílem projektu je napomoci pochopení prvního nezbytného kroku, tj. rozpoznání poškození cisplatinované DNA, v sérii reakcí, které vedou k cytotoxicitě cisplatiny zprostředkovávané MMR systémem.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10610 - Biophysics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The research project was focused mainly on the characterization of an unusual inter-strand crosslink that is formed between G6 and G11 (crosslinked bases marked with asterisk) d(C1C2T3T4G5G*6T7C8T9C10)-d(G*11A12G13A14C15C16A17A18G19G20). Conversion of intra-strand crosslink to inter-strand crosslink after approx. 48-72 hours confirms the kinetic instability of the Pt-N7 bond in the
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2008
Realization period - end
Dec 31, 2010
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 16, 2010
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP11-GA0-GP-U/04:3
Data delivery date
Mar 20, 2015
Finance
Total approved costs
750 thou. CZK
Public financial support
750 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK