Functional analysis of methyltransferase involved in SL RNA modification in Trypanosoma brucei
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 8 (SGA02008GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
204/08/P585
Alternative language
Project name in Czech
Funkční analýza methyltransferázy účastnící se modifikace SL RNA u Trypanosoma brucei
Annotation in Czech
SL RNA u trypanosomatid má významnou roli při "trans-sestřihu" a úpravách mRNA. SL RNA poskytuje každé mRNA tzv. SL sekvenci. SL sekvence je krátký úsek SL RNA charakterizovaný m7G čepičkou na 5´-konci následovanou 4 nukleotidy nesoucími sedm methylových skupin. Tato SL RNA čepička je označována jako "cap 4" a je mezi eukaryotickými organismy jedinečná. RNA methyltransferázy, které katalyzují modifikace SL sekvence u trypanosom jsou rovněž unikátní. Je pravděpodobné, že tyto enzymy, účastnícíse modifikace SL sekvence, hrají hlavní roli v regulaci dostupnosti SL RNA pro "trans-sestřih" a mohou tak být důležitými aktéry v regulaci tohoto zásadního procesu. Během posledních let bylo charakterizováno několik enzymů účastnících se modifikace čepičky SL RNA. Cílem tohoto projektu je analyzovat funkci potenciální methyltransferázy MT420 účastnící se modifikace SL sekvence u Trypanosoma brucei - významného parazitického prvoka savců.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
O - Nesplněno zadání, smlouva však byla dodržena
Project results evaluation
This project has focused on the characterization of the putative methyltransferase MT420 in Trypanosoma brucei, a human pathogenic parasite. MT420 is annotated as a hypothetical protein and was originally thought to play a role in the methylation of theunique cap structure of all T. brucei mRNAs. However, this hypothesis was shown to be incorrect. Bioinformatics have allowed us to identify hig
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2008
Realization period - end
Dec 31, 2010
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 16, 2010
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP11-GA0-GP-U/04:3
Data delivery date
Mar 20, 2015
Finance
Total approved costs
1,035 thou. CZK
Public financial support
1,035 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK