Systematic deconstruction of metabolic syndrome's genetic architecture by gene-expression profiling in a new set of recombinant inbred rat strains
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 5 (SGA02005GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
303/05/P026
Alternative language
Project name in Czech
Systematická dekonstrukce genetické architektury metabolického syndromu pomocí expresního profilování u nové sady rekombinantních inbredních kmenů
Annotation in Czech
Metabolický syndrom je onemocnění s prevalencí dosahující až 25% populace vyspělých zemí. Přestože je jasné, že na patogenezi tohoto onemocnění se podílí interagující genetické a environmentální komponenty, složitost detailní analýzy v heterogenní lidsképopulaci způsobuje, že naše znalosti kauzálních alelických variant jsou nedostatečné. S výhodou se pro tento účel však mohou využít geneticky definované savčí modely, které umožňují identifikaci základních biologických atributů metabolického syndromu a dalších komplexních znaků. V naší studii navrhujeme použití nově ustavené sady rekombinantních inbredních kmenů PXO laboratorního potkana pro identifikaci genomických oblastí a metabolických drah relevantních pro patogenezi metabolického syndromu. Po metabolické charakterizaci jednotlivých kmenů a jejich progenitorů provedeme globální analýzu genové exprese pomocí čipů Affymetrix. Získaný profil exprese 10 - 15 tisíc genů bude tvořit základ pro vazebné mapování, které nám společně se sadou
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
FB - Endocrinology, diabetology, metabolism, nutrition
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30202 - Endocrinology and metabolism (including diabetes, hormones)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Metabolic syndrome is a prevalent condition with equivalent share of genomic and environmental components in its pathogenesis. The aim of our project was the detailed analysis of the genetic component of metabolic syndrome in unique model system of recom
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 2, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-GA0-GP-U/03:2
Data delivery date
Oct 17, 2008
Finance
Total approved costs
1,200 thou. CZK
Public financial support
1,200 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK